Крайне важна противовоспалительная терапия. В ее рамках применяют таблетки, инъекции или мази (а иногда комбинации) Диклофенака, Напроксена и Нимесулида. В тяжелых случаях используется Дексаметазон, Метилпреднизолон или Преднизолон.
Также назначаются иммуносупрессоры (подавляют функцию иммунной системы для устранения аутоиммунных реакций). Используют их только в самых тяжелых случаях, так как лечение ими часто дает серьезные побочные эффекты.
Из иммуносуспрессоров наиболее эффективными при хламидийном артрите являются Метотрексат, Азатиоприн, а также Циклофосфамид и Циклоспорин.